制藥工程專業(yè)依托南京大學化學化工學院、醫(yī)學院辦學，遵循“寬口徑、厚基礎、重應用”的人才培養(yǎng)原則，以“產(chǎn)學研用”為主線，培養(yǎng)適應現(xiàn)代醫(yī)藥工業(yè)需要，能力強、素質(zhì)高、具有創(chuàng)新意識的高級應用技術型人才。該專業(yè)建有設備完善的藥物化學實驗室、藥劑學實驗室、藥物分析實驗室和制藥工藝綜合實驗室，同時依托金陵學院化學與生命科學學院的國家級大學化學實驗教學中心。憑借毗鄰國家級江北新區(qū)生物醫(yī)藥谷的地域優(yōu)勢，已擁有南大藥業(yè)、南京億華藥業(yè)有限公司、南京藥石藥物發(fā)展有限公司、金斯瑞生物科技有限公司、藥捷安康生物科技有限公司、南京復興生物有限公司以及南京高新生物醫(yī)藥公共服務平臺以及七個校外實習基地。