生物醫(yī)學工程專業(yè)是培養(yǎng)從事生物醫(yī)學工程、醫(yī)學儀器、電子信息系統(tǒng)設計以及信息處理等領域的專門人才。人才培養(yǎng)的能力與素質目標是：基礎理論扎實、實踐能力突出、綜合素質全面。知識、素質和能力包含的主要方面是：系統(tǒng)掌握本專業(yè)所涉及的數學、物理、電子電路、信號與信息處理、計算機科學與技術和工程技術的基礎知識；掌握生物醫(yī)學工程領域的專業(yè)知識；掌握電子技術、信號檢測與處理、生命科學、計算機技術在醫(yī)學中的應用以及信息科學的基本理論和基本方法；具備生物醫(yī)學工程研究與開發(fā)的初步能力；具備分析和設計電子設備的基本能力；具有良好的人文社會科學素養(yǎng)；具有組織管理、溝通交流、團隊合作能力。

近年來，生物醫(yī)學工程專業(yè)本科畢業(yè)生每年大約有18%的學生讀研或出國繼續(xù)進行研究生學習；有96%左右的學生就業(yè)，就業(yè)去向主要包括通信、信息相關企業(yè)和醫(yī)療儀器產業(yè)、醫(yī)療衛(wèi)生、商檢、技術監(jiān)督、科研院所等部門。如市藥品監(jiān)督監(jiān)督局寶山分局、上海生物制品研究所、上海醫(yī)療器械廠股份有限公司、上海宏桐實業(yè)有限公司、上海交大海隆軟件股份有限公司、中國檢驗認證集團上海有限公司、上海檢驗公司、上海交通大學醫(yī)學院、上海岱嘉醫(yī)學信息系統(tǒng)有限公司、中國電信上海分公司、華為公司、東方有線網絡公司、中外銀行系統(tǒng)、科研院所、國家機關等。