歷史系始創(chuàng)于1977年，原屬于復(fù)旦大學(xué)分校，1994年，歷史系隨文學(xué)院一起并入新的上海大學(xué)。歷史系自設(shè)立以來(lái)，一直圍繞歷史本科教育展開(kāi)各項(xiàng)教學(xué)活動(dòng)，并逐漸提升學(xué)科水平，建立研究型的系科。目前歷史系有中國(guó)史博士后流動(dòng)站，中國(guó)歷史和世界歷史兩個(gè)一級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)，一個(gè)一級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)——考古學(xué)，從而形成了一個(gè)從本科到博士教育的完整的人才培養(yǎng)基地。
近年來(lái)，歷史系立足于學(xué)科的硬件和軟件建設(shè)，致力于提升整體的教學(xué)與科研水平，推動(dòng)學(xué)科快速發(fā)展。目前本系有教師33人，其中27人具有博士學(xué)位，教授14人，講師11人，博導(dǎo)10人，上海市浦江人才2人、曙光學(xué)者2人，海外歸國(guó)教師8人，從而形成了一支年齡、學(xué)歷結(jié)構(gòu)合理、學(xué)源多元、充滿(mǎn)朝氣的師資隊(duì)伍。
近五年來(lái)，歷史系學(xué)術(shù)成果斐然，主持國(guó)家及省部級(jí)縱向課題36項(xiàng)，其中國(guó)家社科基金12項(xiàng)，教育部人文社科基金4項(xiàng)，2012年，歷史系陶飛亞教授領(lǐng)銜的“漢語(yǔ)基督教文獻(xiàn)書(shū)目的整理與研究”課題和謝維揚(yáng)教授領(lǐng)銜的“中國(guó)國(guó)家起源研究的理論與方法”課題為國(guó)家社科基金重大項(xiàng)目；出版學(xué)術(shù)專(zhuān)著62部，在《中國(guó)社會(huì)科學(xué)》、《歷史研究》、《近代史研究》、《世界歷史》、《史學(xué)理論研究》、Journal of Modern Chinese History、Journal
of Sino-Western Communications、Studies in World Christianity等國(guó)內(nèi)外學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表論文200余篇，獲省部級(jí)科研獎(jiǎng)9項(xiàng)。歷史系已發(fā)展成為上海市乃至全國(guó)的一個(gè)新興的史學(xué)研究重鎮(zhèn)。
通過(guò)長(zhǎng)期的積累和有計(jì)劃的學(xué)科建設(shè)，本系進(jìn)一步加強(qiáng)和優(yōu)化了學(xué)科的布局與結(jié)構(gòu)，形成了與上海、乃至全國(guó)兄弟院校同類(lèi)學(xué)科錯(cuò)位發(fā)展的優(yōu)勢(shì)，在中國(guó)近現(xiàn)代宗教史、中國(guó)近現(xiàn)代學(xué)術(shù)思想史、中國(guó)近現(xiàn)代社會(huì)生活史、中國(guó)古代文明史、西方社會(huì)文化史、全球?qū)W等研究方向上形成了自己的特點(diǎn)和優(yōu)勢(shì)。本學(xué)科2005年就被上海市教委列為第五期重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科，2009年成為上海大學(xué)“211工程”三期重點(diǎn)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目之一。
本系設(shè)有古代文明研究中心、和平發(fā)展研究中心、宗教與中國(guó)社會(huì)研究中心、全球?qū)W研究中心、馬斯托禁毒政策研究中心、考古與博物館學(xué)研究中心等六個(gè)研究中心。這些中心成為了歷史系教師進(jìn)行合作研究和對(duì)外交流的重要平臺(tái)。
本系注重與國(guó)外著名高校、學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的交流。五年來(lái)，我們共計(jì)派出教師14人/次前往牛津大學(xué)、耶魯大學(xué)等海外高校、科研機(jī)構(gòu)訪(fǎng)學(xué)，并與舊金山大學(xué)、美國(guó)宗教學(xué)會(huì)、國(guó)際全球?qū)W合作團(tuán)隊(duì)、納粹大屠殺教育國(guó)際行動(dòng)委員會(huì)、旅美華人歷史學(xué)會(huì)、韓國(guó)高等宗教研究所等合作舉辦了14次國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議。學(xué)科發(fā)展與國(guó)際交流的增多，也為本科生和研究生搭建了廣闊的發(fā)展舞臺(tái)。我們?cè)诱?qǐng)倫敦國(guó)王學(xué)院狄得滿(mǎn)（R.G.Tidemann）教授、美國(guó)哈特福特宗教學(xué)院Doreen McFarlane教授及懷俄明大學(xué)的教師等來(lái)本系開(kāi)課。最近幾年很多本科生和研究生或作為交流生出國(guó)訪(fǎng)學(xué)，或到國(guó)外參加相關(guān)學(xué)術(shù)會(huì)議，有的則通過(guò)考試到美國(guó)、澳大利亞等國(guó)外高校攻讀碩士或博士學(xué)位。由于這種良好的培養(yǎng)機(jī)制，我們的本科生和研究生的培養(yǎng)質(zhì)量迅速提高，有的博士生、碩士生已在《歷史研究》、《世界歷史》等權(quán)威刊物上獨(dú)立發(fā)表論文。