專業(yè)面向國(guó)家醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展趨勢(shì)與人才需求， 以生物制藥、高分子藥物為特色方向，培養(yǎng)能夠在制藥工程 相關(guān)領(lǐng)域從事藥物設(shè)計(jì)、新藥研發(fā)與生產(chǎn)管理的工程技術(shù)人才。專業(yè)前身是 1995 年南京化工學(xué)院生物化工專業(yè)設(shè)立的 微生物制藥方向，1998 年成立制藥工程專業(yè)。2012 年入選 教育部“卓越工程師教育培養(yǎng)計(jì)劃”試點(diǎn)專業(yè)、2019 年入選 國(guó)家首批一流本科專業(yè)。2015、2018 年兩次通過中國(guó)工程 教育專業(yè)認(rèn)證。近年來培養(yǎng)了 300 余名行業(yè)中堅(jiān)和科技領(lǐng)軍 人才，如江蘇柯菲平醫(yī)藥董事長(zhǎng)秦引林、南京新工投資集團(tuán) 總經(jīng)理王雪根等。